Вы находитесь в порту с билетом в новый регион. Но тут появляются полицейские и сообщают, что объявлен карантин и покидать регион нельзя. Вы решаете отправится в штаб ФБ, и просить личного транспорта у Иори. Девушка наотрез отказывается способствовать. Тогда вы должны решить, каким образом будите добираться до Уновы (на ваше усмотрение).

До вас давно доходили слухи о больных покемонов. Вы отправляетесь в покецентр, узнаете, что дела там обстоят не очень. Потом на вас нападают дикие покемоны (больные) и после контакта с ним ваши покемоны заболевают. Но лекарства в Канто нет. Тогда, с помощью организации, вы узнаете, что скорее всего причину нужно искать в Унове. Вы получаете задание от штаба - проникнуть нелегально в новый регион и докладывать обстановку оттуда. Вам дают транспорт. Ночью вы собираетесь отправляться, но на хвост вам садится Ким...